清代太醫(yī)院基本上承襲了明代的編制和職能，除了負責宮廷人員的看病診治外，還要負責皇帝有關(guān)醫(yī)療事務(wù)詔令的貫徹落實，醫(yī)生的培訓考試等工作。

太醫(yī)院的主要職責是侍直，即在宮廷內(nèi)伺候聽命或宿夜值班。院使、院判、御醫(yī)、吏目、醫(yī)士各以所業(yè)�？�，分班入宮，輪流侍直�！罢品职嗍讨保�給事宮中曰宮值，給事外廷曰六值。西苑壽樂房以本院官二人值宿。”光緒十三年（1887年）議定， 西苑（現(xiàn)中南海及北海）壽樂房，每日須有兩名太醫(yī)院官值宿，藥庫的庫掌、筆帖式等，遇差傳喚；乾清宮御藥房，每日由太醫(yī)院大、小方脈二科各一人值宿，以供進御。此外，文武會試、順天鄉(xiāng)試，“由院遴選通曉醫(yī)理之大方脈科、瘡瘍科各一人，申送委用”；刑部監(jiān)獄，“由院選派醫(yī)生二人供役，每月給發(fā)藥價銀米。效力滿六年，割回到院，升授吏目”；凡諸王、公府及文武大臣，外藩、公主、額駙及臺吉大臣和軍營需醫(yī)，太醫(yī)院要奉旨差官醫(yī)治。

太醫(yī)難當

太醫(yī)地位雖然尊崇，但是“伴君如伴虎”，民間有“太醫(yī)難當”之說。清初太醫(yī)院醫(yī)官除看病處方外，還要為帝王煎藥�！短�醫(yī)院志》記載：“凡烹調(diào)御藥，本院官請脈后,開方具本奏明，同內(nèi)臣監(jiān)視。每一劑備二服，合為一服。候熟，分貯二器。本院官先嘗之，次內(nèi)臣嘗之。其一器進御。”為皇帝煎御藥，太醫(yī)與內(nèi)臣要一道監(jiān)視，待藥煎好后，分別倒入兩杯中，一杯先由主治御醫(yī)先嘗，后由院判、醫(yī)官、煎藥太監(jiān)依次飲嘗，另一杯則進呈皇帝服用。溥儀在《我的前半生》中說：“按照常例，皇帝得病，每天太醫(yī)開的藥方都要分抄給內(nèi)務(wù)府大臣們每人一份，如果是重病，還要抄給軍機大臣一份�！�

御醫(yī)整日小心翼翼，謹慎從事，如履薄冰。如果方子難以奏效，太醫(yī)輕則遭到申斥，重則受到嚴厲懲處。如康熙四十五年（1706年）十一月二十四日，太醫(yī)院院使孫之鼎等承旨治療正黃旗內(nèi)大臣頗爾盆痔漏復發(fā)癥，康熙對他們的治療情況非常不滿，曾在朱批中大發(fā)雷霆，寫道：“庸醫(yī)誤人，往往如此�！惫饩w帝死前的一兩年間，因病情復雜，太醫(yī)難以治愈，而光緒本人又怨天尤人，他在自書的“病原”中，曾多次對應(yīng)診的太醫(yī)惡語相加，發(fā)泄不滿。光緒帝死后，太醫(yī)院院使張仲元、御醫(yī)全順、醫(yī)士忠勛等均以“未能力圖保護，厥咎甚重”之類的罪名，受到“即行革職，戴罪當差”等例行處分。

醫(yī)而升官

當時也有因給皇帝或太后醫(yī)好病而升官的，江蘇無錫人薛福辰就是其中一個。

薛福辰，字振美，號撫屏，祖籍江蘇無錫，生于道光十二年（1832年）。薛福辰天資聰明，7歲即能作文，自幼埋頭苦讀經(jīng)史，并且喜讀《黃帝內(nèi)經(jīng)》《本草綱目》等醫(yī)書。18歲考取秀才，23歲中舉，后在北京任工部員外郎。咸豐十年（1860年），被人推薦到李鴻章幕府供職，得到李鴻章的賞識，被提拔為候補知府，到山東補用。正值黃河決口，洪水滔滔，泛濫成災(zāi)，餓殍遍地。山東巡撫丁寶楨知道薛福辰精通水利，便召他協(xié)助治理黃河水災(zāi)。薛福辰深入到抗洪第一線，綜合整治，組織民工搶險救災(zāi)，成功堵塞決口，并節(jié)約不少白銀。薛福辰抗洪有功，再一次得到李鴻章的重用，被調(diào)任候補道員，補山東濟東泰武臨道。在任4年，他勤政為民，勵精圖治，民眾安居樂業(yè)。他因酷愛岐黃，在公務(wù)之余自學醫(yī)術(shù)，研讀諸家醫(yī)典，竟學有所成，名滿南北。李鴻章對其十分了解。

光緒六年，年已46歲的慈禧太后突然感到身體不適，茶飯不思，嘔吐不止，經(jīng)太醫(yī)院的御醫(yī)診斷為血蠱證。血蠱是由瘀血內(nèi)停，因循日久所致的鼓脹證。面對慈禧日益見長的腹部，太醫(yī)們急得團團轉(zhuǎn)，束手無策，朝廷只得下詔遍征名醫(yī)�？墒�，全國各地的名醫(yī)應(yīng)召而來者倒是不少，但是收效甚微。慈禧整日憂心忡忡，精神不振。她的心腹大臣李鴻章深知薛福辰的醫(yī)學本領(lǐng)，所以向慈禧太后和光緒皇帝保薦他入宮治病。

薛福辰接旨后不敢怠慢，日夜兼程趕赴京城。當他到達皇宮后，各地名醫(yī)云集，其中有曲陽知縣汪守正和常州孟河名醫(yī)馬培之。薛福辰通過把脈，也診斷為血蠱證。他詢問了以前所用藥方后，開了幾服藥，所不同的都是疏通補養(yǎng)之品。慈禧服用后大見成效，令前去會診的太醫(yī)和各地名醫(yī)大為贊嘆。于是，薛福辰被留在宮中做事，王公大臣前來醫(yī)治者絡(luò)繹不絕。

光緒八年（1882年）十二月，慈禧病體痊愈，薛福辰因治病有功，加賞頭品頂戴，調(diào)補直隸通永道。這年除夕，慈禧親書“�！弊趾汀奥殬I(yè)修明”匾額賜之，同時賜紫蟒袍、玉鉤帶一副，又賜宴體元殿、長春宮聽戲。

薛福辰不僅醫(yī)術(shù)高明，而且為官有道，在直隸任內(nèi)政績卓著，得到民眾的交口稱贊。光緒十二年（1886年），薛福辰升任順天府尹。第二年冬調(diào)宗人府丞，一年后又授都察院左副都御史。不料突患中風，半身不遂，于光緒十五年（1889年）夏疏請退職，同年7月病逝，皇帝賜白銀500兩治喪。